Di solito non ci sono molte ragioni per usare diversi filesystem. Al momento, l'ex2fs è il più comune, e probabilmente è la scelta più saggia. A seconda delle necessità globali di strutture di archiviazione, velocità, affidabilità (visibile), compatibilità e svariate altre ragioni può essere consigliabile usare un altro filesystem. La scelta va fatta caso per caso.